Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms