Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trpt1Q8K3A2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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