Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf13Q8K2W6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms