Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RdxP26043 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RdxP26043 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RdxP26043 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RdxP26043 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms