Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms