Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap53Q9D439 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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