Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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