Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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