Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb4Q02738 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms