Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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UbdP63072 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
UbdP63072 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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UbdP63072 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
UbdP63072 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
UbdP63072 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
UbdP63072 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
UbdP63072 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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