Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms