Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb1P28230 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms