Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gata1P17679 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gata1P17679 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms