Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms