Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17lcG5E8I7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms