Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Usp9yF8VPU6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Usp9yF8VPU6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Usp9yF8VPU6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Usp9yF8VPU6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Usp9yF8VPU6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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