Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Palm3A2TJV2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms