Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
CcniQ9Z2V9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CcniQ9Z2V9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms