Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Crlf3Q9Z2L7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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