Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Stx12Q9ER00 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms