Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms