Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PAGR1Q9BTK6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms