Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme8Q715T0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms