Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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