Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms