Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms