Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms