Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.4 ms