Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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