Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms