Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms