Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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