Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmco3Q8BH01 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms