Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrrc58Q3UGP9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrrc58Q3UGP9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lrrc58Q3UGP9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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