Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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