Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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HDAC1Q13547 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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