Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp1Q00915 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rbp1Q00915 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms