Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc10P31257 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms