Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ArxO35085 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ArxO35085 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms