Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ube3aO08759 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ube3aO08759 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ube3aO08759 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ube3aO08759 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ube3aO08759 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3aO08759 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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