Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm5458L7N219 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm5458L7N219 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm5458L7N219 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm5458L7N219 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm5458L7N219 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm5458L7N219 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm5458L7N219 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm5458L7N219 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5458L7N219 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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