Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms