Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms