Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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