Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm4sf20Q9CQY8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms