Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nup155Q99P88 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nup155Q99P88 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms