Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms