Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms