Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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