Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp12Q6P5B0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms